美杜莎的高貴美麗被海神波塞冬發現了，波塞冬又比較貪戀美色，對任何漂亮的美女都想入非非，美杜莎動人的美貌，讓波塞冬把持不住自己。于是，好不容易抓住機會的波塞冬，在發現美杜莎一個人在雅典娜神廟中時，就忍不住向美杜莎伸出了魔爪把她玷污了。
美杜莎被玷污后，萬分痛苦的她向自己的主神哭訴，她多么希望雅典娜可以為自己主持公道。可美杜莎怎么也不會想到，雅典娜卻直接拒絕了她。因為波塞冬是父親的哥哥，雅典娜看在自己父親的份上也不能懲罰他，只能把氣撒在無辜的美杜莎身上，雅典娜竟然認為是美杜莎玷污了自己的神廟，因為她不再純潔了。所以不但拒絕了美杜莎的祈求，還奪走了美杜莎美麗的容顏，將她變成了一個蛇發女妖。
雅典娜認為美杜莎既然那么吸引他人的喜歡，就給可憐的美杜莎下了詛咒，凡是她看到的人都會變成石頭，還將美杜莎的美貌一并收走了。無奈的美杜莎只能遠離人群，最后還被流放到荒島上。美杜莎本是無辜的受害者，但放逐后的美杜莎，恨透了所有男人，最終從高貴純潔的大祭司變成了兇狠惡毒的蛇發魔女。