劇中吳邪因為老馬的描述對秦嶺古墓產生興趣，和王胖子相約一起去探尋青銅樹的秘密，但是沒想到遭遇危難，遇到各種可怕的水怪、毒蟲。
吳邪和王胖子兩人走散，王胖子被毒蟲咬傷，在王胖子即將撐不住的時候，張起靈出現，救下王胖子，之后兩人找到吳邪，一同解開關于青銅樹的秘密。
吳邪之所以來秦嶺其實是老癢的計謀，老癢想要借助吳邪豐富的考古知識，幫助自己復活母親，但是并沒有成功，自己的命也搭進去了。
《怒海潛沙&秦嶺神樹》是根據小說《盜墓筆記》改編的，《秦嶺神樹》篇中張起靈出現，王胖子也沒有多少戲份，但是在劇中多了不少關于他們的支線，因此產生了些爭議，認為吳邪不能夠一直以來小哥的幫助，自己也要成長。
面對爭議，導演解釋單一不變的故事線不利于全方位展示秦嶺神樹，張起靈和王胖子的出現，更容易塑造吳邪的人設，使吳邪、張起靈、王胖子鐵三角的關系更緊密。